蒙納士大學成為了久負盛名的大學聯盟 – 澳大利亞八校聯盟的創始成員。澳大利亞八校聯盟由8所澳大利亞最頂尖的研究密集型大學組成 - 墨爾本大學、蒙納士大學、澳大利亞國立大學、悉尼大學、昆士蘭大學、西澳大學、阿德萊德大學和新南威爾士大學。蒙納士大學院系組成，他們分別是：

藝術、設計與建築學院（Faculty of Art, Design and Architecture）：下設藝術系、設計系、建築系。

文學院（Faculty of Arts）：設有語言學系、媒體電影與新聞學系、哲學歷史與國際研究學系、社會科學系、音樂學系、文學與社會科學系（馬來西亞校區）。另外還有兩個研究中心：蒙納士戲劇與表演中心、蒙納士土著學研究中心。

商業與經濟學院（Faculty of Business and Economics）：設有會計系、金融系、商法與稅務系、計量經濟與商業統計學系、經濟學系、管理學系、營銷學系、領導力與決策教育系。另設四個研究中心：蒙納士金融研究中心、發展經濟學與可持續性研究中心、國際商業研究中心、健康經濟學中心。

教育學院（Faculty of Education）

工學院（Faculty of Engineering）：設有化學工程系、土木工程系、電子及計算機系統系、材料科學與工程系、機械與航天工程系。

信息技術學院（Faculty of Information Technology）：設有兩個研究中心：數據科學中心、組織與社會信息學中心。

法學院（Faculty of Law）：設有人權法系、法律健康與福祉系、女權主義法系、可持續發展法律實踐系、跨國刑法系。學院另設兩個研究中心：澳大利亞司法與革新研究中心、商法與管理研究中心。

醫學、護理與健康科學學院（Faculty of Medicine, Nursing and Health Sciences）：設有三個學院與七個學系，它們分別是：中心臨床醫學院、臨床醫學科學院、東部臨床醫學院、醫學系、護理學系、基層醫療與保健系、公共衛生與預防醫學系、鄉鎮醫療系、生物醫學系、心理學系。學院附屬或合作的醫學研究院多達36個，其中包括6個澳大利亞國立醫學研究中心（微生物基因組學、重症醫療、健康風險評估、血液病、再生醫學、創傷）、澳大利亞考科藍組織，以及國際知名的哈德森研究院（Hudson Institute）、伯內特研究院（Burnet Institute）、貝克心臟與糖尿病研究院（Baker Heart and Diabetes Institute）、阿爾弗萊德研究中心（Alfred Centre）。